โครงการประเมินคุณภาพห้องปฏิบัติการโดยองค์กรภายนอก (The External Quality Assessment Schemes in Clinical Laboratory) คณะเทคนิคการแพทย์ มหาวิทยาลัยมหิดล ได้เริ่มดำเนินการตั้งแต่ ปี พ.ศ. 2528 จากการริเริ่มของศาสตราจารย์วีกูล วีรานุวัตติ์ คณบดี ท่านแรก นับเป็นปฐมบทของการควบคุมคุณภาพการวิเคราะห์ทางห้องปฏิบัติการทางการแพทย์ ในประเทศไทยและภูมิภาคอาเซียน และมีการดำเนินการพัฒนาโครงการต่างๆ เพื่อให้ครอบคลุมงานทางห้องปฏิบัติการทุกด้าน ปัจจุบันคณะเทคนิคการแพทย์ มหาวิทยาลัยมหิดล ได้ให้บริการโครงการประเมินคุณภาพห้องปฏิบัติการโดยองค์กรภายนอก จำนวนทั้งสิ้น 10 โครงการ จำแนกเป็น 5 สาขา ดังนี้
1. สาขาเคมีคลินิก
2. สาขาจุลทรรศนศาสตร์คลินิก
3. สาขาปรสิตวิทยา (The External Quality Assessment Scheme in Parasitology: EQAP)
4. สาขาภูมิคุ้มกันวิทยาคลินิก
5. สาขาจุลชีววิทยาคลินิก (The External Quality Assessment Scheme in Bacteriology, EQAB)
จากการดำเนินการที่ผ่านมาพบว่าจำนวนสมาชิกของโครงการมีแนวโน้มเพิ่มขึ้นทุกๆ ปี และทางโครงการได้มีการปรับปรุงการดำเนินงานให้สอดคล้องตามมาตรฐาน ISO/IEC 17043 ซึ่งจะทำให้เกิดประโยชน์สูงสุดแก่ห้องปฏิบัติการสมาชิก จึงหวังว่าห้องปฏิบัติการทางการแพทย์จะให้ความไว้วางใจเข้าร่วมเป็นสมาชิกของโครงการอย่างต่อเนื่องต่อไป